ICM-Pro geeft biologen en chemici de macht door een hoogwaardige eiwitstructuuranalyse, modellering en docking desktop softwareomgeving te bieden. U hebt directe toegang tot sequentie- en structuurdatabases waarmee u: sequenties en alignments kunt analyseren, eiwitstructuren kunt inspecteren, pockets en gebonden liganden en medicijnen kunt bestuderen, oppervlakken kunt creëren, elektrostatica kunt berekenen, mutaties kunt maken, ligandbindingssites kunt voorspellen, eiwit-eiwitinteractiesites kunt voorspellen, kleine moleculen en eiwit-eiwitdocking kunt uitvoeren en liganden kunt ontwerpen met behulp van de Interactive Ligand Editor.
Analyse van eiwitstructuur. ICM-Pro biedt een directe link naar de Protein Data Bank (PDB). Nadat u een structuur hebt gedownload, kunt u de structuur analyseren - Ramachandran-plots maken, meerdere structuren over elkaar heen leggen, afstanden en hoeken analyseren, contact- en oppervlaktegebieden berekenen, waterstofbruggen weergeven, elektrostatische oppervlakken bouwen en ligandbindingsholtes berekenen.
ICM Pocket Finder. ICM Pocket Finder is een methode die ligandbindingsplaatsen in elke eiwit-, DNA- of RNA-structuur identificeert. Eiwit-ligandbindingsplaatsen worden geïdentificeerd op basis van de rasterpotentiaalkaart van de Van der Waals-interactie van de receptor en de oppervlakken worden gecontourd. Fysieke eigenschappen van de holtes worden vervolgens berekend en getabelleerd en er wordt een score voor geneesmiddelgelijkenis gegeven. Lees meer...
ICM 3D Interactive Editor. Bewerk interactief een chemische stof in een receptorbindingsholte. Wijzig atomen en groepen en bekijk het effect van de veranderingen op de ligandbindingsenergie en -score. Dock opnieuw en minimaliseer ligandkristallografische
analysetools. De sleutel tot het begrijpen van een eiwitstructuur is het volledig evalueren van de onderliggende kristallografische informatie in een PDB-bestand. Het is bijvoorbeeld belangrijk om de volledige biologische eenheid van een proteïne te begrijpen om te bepalen of kristal-kristalcontacten de structuur hebben beïnvloed of u wilt misschien de elektronendichtheid contouren om te zien hoeveel van een ligand door de kristallograaf in de actieve site is gezien Systeemvereisten
OS: Alle vensters worden ondersteund
Ruimte: 1 GB schijfruimte en
Geheugen: 2 Gb of meer RAM 4 Gb is een goede standaard.
GPU: GeForce-modellen zijn goed als u geen hardwarestereo wilt gebruiken.
Altijd als Administrator uitvoeren en virusscanner uit!
